這作的劇情完全靠圖鑒來推動，因為不是現代背景，所以沒有那種你抓到一隻寶可夢他的數據就會立馬出現在圖鑒上這種情況，每隻寶可夢的圖鑒都有十個等級，達到十級才算完成這只寶可夢的圖鑒.玩家可以通過完成這只寶可夢的課題來提升等級，抓到新的寶可夢和完成課題後，需要玩家去找博士進行匯報，圖鑒才會進行更新。
